Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms