Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC34Q96HJ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms