Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC35A4Q96G79 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms