Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4CQ96CF2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4CQ96CF2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms