Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms