Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX21Q969T3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms