Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms