Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF1Q92994 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms