Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF3AQ92664 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms