Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms