Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TCF23Q7RTU1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms