Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2AFVQ71UI9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2AFVQ71UI9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms