Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF7Q6Q0C0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF7Q6Q0C0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms