Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFCAB12Q6NXP0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFCAB12Q6NXP0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms