Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPPQ6IPU0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms