Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms