Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms