Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL22Q53GT1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms