Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL40Q2TBA0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms