Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC96Q2M329 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC96Q2M329 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms