Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDKN3Q16667 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN3Q16667 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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