Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALX1Q15699 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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