Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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