Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNASE1L3Q13609 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNASE1L3Q13609 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms