Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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