Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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