Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms