Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMOD3Q0VAK6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms