Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms