Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms