Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms