Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKCDQ05655 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms