Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms