Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms