Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREMQ03060 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREMQ03060 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREMQ03060 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CREMQ03060 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREMQ03060 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREMQ03060 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREMQ03060 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CREMQ03060 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms