Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK6Q00534 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms