Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPNP63162 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPNP63162 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms