Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO4P61968 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO4P61968 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms