Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms