Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE1P56817 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE1P56817 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms