Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP1P56182 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP1P56182 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms