Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL23P55773 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCL23P55773 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCL23P55773 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL23P55773 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms