Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms