Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GSK3BP49841 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms