Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCT3P49368 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCT3P49368 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCT3P49368 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms