Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME1P48163 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ME1P48163 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME1P48163 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME1P48163 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME1P48163 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ME1P48163 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME1P48163 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms