Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNT3P45378 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT3P45378 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT3P45378 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT3P45378 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT3P45378 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT3P45378 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNT3P45378 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT3P45378 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT3P45378 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT3P45378 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT3P45378 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT3P45378 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms