Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA1P38398 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms