Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPC1P35052 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPC1P35052 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPC1P35052 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPC1P35052 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPC1P35052 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms