Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA10P31260 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA10P31260 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms